IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO IN SILICO DE RNAS LONGOS NÃO-CODIFICANTES EM RAIZ DE SOJA COLONIZADA POR HETERODERA GLYCINES ICHINOHE

O objetivo deste trabalho é identificar e caracterizar RNAs longos não-codificantes em raiz de soja (Glycine max e Glycine soja) colonizada pelo nematoide-do-cisto Heterodera glycines. A soja é uma das culturas mais importantes do agronegócio, fornecendo óleo e proteínas. Como outras culturas, a soja sofre com os efeitos do ataque de pragas. O nematoide-do-cisto da soja é a principal praga a atacar a soja nos Estados Unidos e em vários outros lugares. Faz-se necessário, portanto, identificar os mecanismos moleculares responsáveis pela resposta da soja ao nematoide. Foram empregadas ferramentas de bioinformática para a identificação e caracterização dos lncRNAs. Foram utilizadas, neste estudo, bibliotecas de RNA-seq de quatro genótipos de soja: dois susceptíveis (cultivar PI509044 (Williams 82), Glycine max; e ecótipo S-soja, Glycine soja,) e dois genótipos resistentes (cultivar Peking, Glycine max; e ecótipo NRS100, Glycine soja). No transcriptoma de Williams 82, foram identificados 944 lncRNAs; em Perking, foram identificados 793 lncRNAs; em NRS100, foram identificados 31.543 lncRNAs e, finalmente, em S-soja, 33.450 lncRNAs. Análise de conservação com lncRNAs de Arabidopsis e Vigna revelou uma baixa similaridade dos lncRNAs de G. max, com uma maior quantidade de lncRNAs das espécies selvagens (NRS100 e S-soja) com alguma similaridade com lncRNAs de V. unguiculata. Foram identificados 43 lncRNAs-alvos de miRNAs. A predição da localização subcelular dos lncRNAs selecionados apontou, principalmente, o citoplasma como compartimento, com apenas dois lncRNAs preditos para o núcleo. A análise de expressão indicou que alguns lncRNAs são estimulados pela presença do nematoide, enquanto outros parecem ter sua expressão suprimida. Conclui-se que lncRNAs de soja podem estar envolvidos na resposta da planta ao nematoide, sendo alvos de miRNAs de diferentes famílias.